Referências
Shimizu, G. D., Marubayashi, R. Y. P. and Gonçalves, L. S. A. (2023). AgroR: Experimental Statistics and Graphics for Agricultural Sciences. R package version 1.3.3. Disponível em: https://cran.r-project.org/web/packages/AgroR/index.html
Entrada de dados
O AgroR Shiny App permite a entrada de dados em extensão .csv (Separação por vírgula, ponto e vírgula ou ponto), .xls ou .xlsx. A entrada de dados muda de acordo com o número de fatoresNota: A tabulação de dados deve ser feito com as variáveis em coluna
Análise
A aba 'Análise descritiva', em 'Resumo', apresenta os valores de média, mediana, variância amostral, desvio-padrão amostral e coeficiente de variação geral e separado por fator(es)Nessa aba, em 'Gráficos', é retornado gráfico de caixas separados por fator.
Resumo geral
Resumo Fator 1
Resumo Fator 2
Resumo Fator 3
Interação Fator 1 × Fator 2
Interação Fator 1 × Fator 3
Interação Fator 2 × Fator 3
Interação Fator 1 × Fator 2 × Fator 3
O croqui experimental do AgroR Shiny App é limitado ao formato retangular. Por exemplo, no caso de um experimento em delineamento inteiramente casualizado com cinco tratamentos e quatro repetições, retorna uma matriz 5 × 4 ou 4 × 5.
Nos tratamentos, você pode definir o número de níveis de fator ou escrever o nome dos tratamentos separados por ';'. Por exemplo 5 ou 1; 2; 3; 4; 5.
É possível trocar linhas por colunas através da janela 'Posição das repetições'. Isso altera a matriz de 5 × 4 para 4 × 5, por exemplo.
Para adicionar ruas nos eixos x e y por meio das janelas 'Adicionar ruas eixo x' e 'Adicionar ruas eixo y', digite o número de colunas com eixo x ou y que deseja unir. Por exemplo, suponha que você tenha 5 linhas e 4 colunas e queira adicionar uma rua entre a segunda e a terceira coluna, deve-se adicionar em 'Adicionar ruas no eixo x' na seguinte ordem 1;1;2;2
Na caixa 'Deseja representar apenas a identificação?', se a opção 'Sim' estiver marcada, será retornado apenas a identificação e um arquivo dataset.csv.
Na caixa 'Deseja corrigir um esboço?', permite gerar sempre o mesmo layout de esboço. Forneça o modelo em 'Qual é o modelo?'.
Nos tratamentos, você pode definir o número de níveis de fator ou escrever o nome dos tratamentos separados por ';'. Por exemplo 5 ou 1; 2; 3; 4; 5.
É possível trocar linhas por colunas através da janela 'Posição das repetições'. Isso altera a matriz de 5 × 4 para 4 × 5, por exemplo.
Para adicionar ruas nos eixos x e y por meio das janelas 'Adicionar ruas eixo x' e 'Adicionar ruas eixo y', digite o número de colunas com eixo x ou y que deseja unir. Por exemplo, suponha que você tenha 5 linhas e 4 colunas e queira adicionar uma rua entre a segunda e a terceira coluna, deve-se adicionar em 'Adicionar ruas no eixo x' na seguinte ordem 1;1;2;2
Na caixa 'Deseja representar apenas a identificação?', se a opção 'Sim' estiver marcada, será retornado apenas a identificação e um arquivo dataset.csv.
Na caixa 'Deseja corrigir um esboço?', permite gerar sempre o mesmo layout de esboço. Forneça o modelo em 'Qual é o modelo?'.
Delineamento inteiramente casualizado
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Conjunto de dados 'romã'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'bean'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'pepper'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'bean'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'pepper'
Delineamento em blocos casualizados
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Conjunto de dados 'orange'
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Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'soybean'
Delineamento em quadrado latino
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Conjunto de dados 'pork'
Delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial duplo
Delineamento em blocos casualizados em esquema fatorial duplo
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Conjunto de dados 'cloro'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'covercrops'
Download csv Download xlsx Conjunto de dados 'covercrops'
Delineamento em blocos casualizados em esquema de parcela subdividida
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Conjunto de dados 'tomato'
Entrada de dados
O AgroR Shiny App permite a entrada de dados em extensão .csv (Separação por vírgula, ponto e vírgula ou ponto), .xls ou .xlsx. A entrada de dados muda de acordo com o número de fatoresNota: A tabulação de dados deve ser feito com as variáveis em coluna.
Análise
Visão geral
O aplicativo realiza análise de efeitos fixos de variância para todos os projetos experimentais. A saída da análise é basicamente dividida em: Anova, boxplot, suposições, gráfico residual, testes complementares (Médias ou teste de regressão) e um ou mais gráficos.Anova
A aplicação retorna na janela 'Anova', o quadro de análise de variância.
Pressuposições da análise de variância
A suposição de normalidade de erros e homogeneidade de variâncias é retornada na janela 'Pressuposições'. Neste caso, você pode alterar os testes desejados. A exceção é para o teste de independência de erro, no qual apenas o teste de Durbin-Watson é implementado.
Gráfico de resíduos padronizados
Na janela gráfica 'Gráfico de resíduos', retorna-se o gráfico de resíduos padronizados. Neste tópico, é possível identificar a presença de outliers. No gráfico, os limites -3 e 3 são usados como forma de identificar esses outliers.
Teste de médias ou regressão polinomial
Na janela gráfica 'Testes complementares', são retornados os testes de média ou regressão. Neste tópico, você deve informar se o fator ou fatores possuem níveis qualitativos (padrão) ou quantitativos. É também neste tópico que você define qual teste de média deseja utilizar e/ou qual grau de polinômio (no caso de fator quantitativo).
No caso de mais de um fator estudado, como esquema fatorial ou plotagem subdividida, e quando houver interação significativa, usar a separação por vírgula para definir o grau do polinômio.
Para escolher o grau do polinômio, use 0 (Não significativo), 1 (linear), 2 (quadrático) e 3 (cúbico).
Gráficos
Por fim, na aba 'Gráfico', são exibidos um ou mais gráficos de acordo com o projeto experimental. Ele retorna gráficos de coluna, caixa, segmento ou regressão. É nesta aba que é possível alterar diversos parâmetros do gráfico, como cor, tamanho da fonte, fonte, dimensão, nome do eixo, etc...
Independência dos erros (Durbin-Watson)
Interpretação: valor de p maior que o nível de significância adotado (geralmente 0,05), a hipótese nula não é rejeitada (Erros seguem distribuição normal, tratamentos têm a mesma variância e erros são independentes).
Essa função equivale ao summarise_anova do AgroR
Transformação
Entrada de dados
O AgroR Shiny App permite a entrada de dados em extensão .csv (Separação por vírgula, ponto e vírgula ou ponto), .xls ou .xlsx. A entrada de dados muda de acordo com o número de fatoresNota: A tabulação de dados deve ser feito com as variáveis em coluna
Efeito isolado e Resumo da Anova
Teste de média do desdobramento da interação
Entrada de dados
O AgroR Shiny App permite a entrada de dados em extensão .csv (Separação por vírgula, ponto e vírgula ou ponto), .xls ou .xlsx. A entrada de dados muda de acordo com o número de fatoresNota: A tabulação de dados deve ser feito com as variáveis em coluna
Análise
Visão geral
O aplicativo realiza o teste de dunnett para experimentos conduzidos em delineamento inteiramente casualizado e blocos casualizados. A saída da análise é basicamente dividida em: Contrastes entre os tratamentos e um gráfico com intervalo de confiança.Definição de parâmetros para análise
A aplicação exige que determinados parâmetros sejam definidos antes da análise. Na janela abaixo, deve-se definir qual o delineamento experimental utilizado:
Contrastes
Uma vez executado os comandos, na janela 'Teste de Dunnett' é retornado os contrastes com o tratamento de referência. Nessa tabela é retornado a estimativa do contraste, o intervalo de confiança (Inferior e superior), o valor da estatística do teste (t), o valor de p e se houve diferença significativa.
Gráficos
Por fim, na aba 'Gráfico', é retornado um gráfico com as estimativas dos contrastes e o intervalo de confiança.
Função em desenvolvimento (Aguarde a conclusão)
Entrada de dados
O AgroR Shiny App permite a entrada de dados em extensão .csv (Separação por vírgula, ponto e vírgula ou ponto), .xls ou .xlsx. A entrada de dados muda de acordo com o número de fatoresNota: A tabulação de dados deve ser feito com as variáveis em coluna
Análise
Visão geral
O aplicativo realiza o teste de não-paramétrico de Kruskal-Wallis ou de Friedman para experimentos conduzidos em delineamento inteiramente casualizado e blocos casualizados, respectivamente.Definição de parâmetros para análise
A aplicação exige que determinados parâmetros sejam definidos antes da análise. Na janela abaixo, deve-se definir qual o delineamento experimental utilizado:
Estatística do teste
Uma vez executado os comandos, na janela 'Teste não-paramétrico' é retornado a estatística do teste e o valor de p.
Teste post-hoc
Na aba 'Teste complementar' é retornado o teste de médias não-paramétrico (as correções do valor podem ser alteradas usando o botão localizado abaixo do delineamento experimental.
Gráficos
Por fim, na aba 'Gráfico', é retornado um gráfico de coluna, caixa ou pontos. Sendo alterar diversos parâmetros do gráfico, como cor, tamanho da fonte, fonte, dimensão, nome do eixo, etc...
Matriz Todos vs Todos
Maiores razões ordenadas
Agrupamento
The AgroR Shiny App allows the input of data in .csv extension (Separated by comma, period or semi-colon), .xls or .xlsx
Note. The tabulation of data must be done in columns, each one being represented by a factor or response variable
Note. The tabulation of data must be done in columns, each one being represented by a factor or response variable
Analysis
General Painel
The AgroR Shiny App allows the input of data in .csv extension (Separated by comma, period or semi-colon), .xls or .xlsx
Note. The tabulation of data must be done in columns, each one being represented by a factor or response variable
Note. The tabulation of data must be done in columns, each one being represented by a factor or response variable